專項審計是審計人員對被審單位特定事項進行的審核、稽查。如： 對企業(yè)的審計，只審查企業(yè)經(jīng)濟活動，如是否偷稅、漏稅。現(xiàn)金業(yè)務是否符合現(xiàn)金管理規(guī)定，某項經(jīng)營是否合法、有效等等。專項審計如能與資金平衡表審計或詳細審計配合，可以收到更好的效果。
通常情況下，專項審計包含離任審計、清算審計、改制審計、司法鑒定審計、財產(chǎn)轉移審計、貸款審計、移民審計、年檢審計、高新技術企業(yè)認定審計等。因此，籠統(tǒng)地講，專項審計是對某種特定審計項目的總稱專項審計。具體說明如下：
（1）離任審計。離任審計是指審計人員對法定代表人整個任職期間經(jīng)濟責任履行情況所進行的審查、鑒證和總體評價，其是考核責任人任職期間的業(yè)績，明確劃分前后任經(jīng)濟責任的有效方法。
（2）清算審計。清算審計是指企業(yè)由于各種原因終止，對其清算期間的債權債務清償情況、資產(chǎn)變現(xiàn)情況、 清算期間的收益、損失、費用支出情況及清算截止日凈資產(chǎn)分配情況進行的審計，以確認清算企業(yè)是否合法、公開、公正進行全部清算活動，并對清算結果發(fā)表合法、公允的審計意見。
（3）改制審計。改制審計是指全民所有制企業(yè)或集體所有制企業(yè)改變其所有權性質，通常是在變更為按《公司法》設立的有限責任公司中需要進行的審計。其具體包括初始投資認定審計、財產(chǎn)損失認定審計、財務狀況認定審計。該審計報告可提供給財政局、工商局、企業(yè)上級單位等相關部門。
（4）司法鑒定審計。其是指在訴訟中接受法院、檢察院、公安機關或當事人的委托，對涉及訴訟經(jīng)濟事項的事實、形成過程、原因及結果進行的專項審計。通常我們對這種審計實施特殊的審計程序，其結果具備法律效力。
（5）財產(chǎn)轉移審計。財產(chǎn)轉移審計對股東投入到公司的實物資產(chǎn)是否已移交給公司、是否已登記入賬、并辦理了相關財產(chǎn)轉移手續(xù)進行的一種專項審計。該審計報告通常是提供給工商局辦理登記的必要文件。
（6）貸款審計。貸款審計提供給銀行，作為審查企業(yè)是否具備銀行要求的貸款條件，以及對貸款使用情況進行的專項審計。在審計報告中不僅會對會計報表發(fā)表審計意見，同時也對企業(yè)經(jīng)營管理狀況、財務狀況、貸款使用情況等發(fā)表意見。是銀行規(guī)避貸款風險，企業(yè)展示經(jīng)營狀況必不可少的依據(jù)。