企業要做好企業所得稅匯算清繳工作，應在準確會計核算的基礎上，注意以下幾個問題。
1.申報匯繳要按期
納稅人應在納稅年度終了后5個月內，向主管稅務機關申報納稅。因不可抗力，不能按期辦理的，可按照《稅收征管法》及其實施細則的規定，辦理延期納稅申報。
2.財產損失要申報
企業發生的資產損失，應按規定的程序和要求向主管稅務機關申報后方能在稅前扣除。未經申報的損失，不得在稅前扣除。
3.減免優惠要備案
納稅人享受備案類減免稅，應提請備案，經稅務機關登記備案后，自登記備案之日起執行。納稅人未按規定備案的，一律不得減免稅。
4.納稅事項要調整
賬務調整必須進行賬內調整，通過調整使之符合會計規定；納稅調整只是在賬外調整，即只在納稅申報表內調整，通過調整使之符合稅法規定。
5.年度虧損要彌補
企業納稅年度發生的虧損，準予向以后年度結轉，用以后年度的所得彌補，但結轉期最長不得超過5年。
6.填報口徑要統一
準備金稅前扣除、資產損失稅前扣除、不征稅收入、免稅收入、投資損失扣除、稅收優惠、彌補虧損、企業資產處署等系列數據填報，要遵循有關稅收法規、財務制度規定，確保口徑一致。
7.電子申報程序要熟練
企業在錄入數據的時候，每張表格包括主表、附表和財務報表都要填寫，沒有數據的就填零。特別是財務報表的期初和期末數都要填，而且資產負債表的期初數不能為零。新開戶的企業資產負債表的期初數就填寫企業開業時的經濟狀態，記住不能為零。在申報表的主表中，如果企業是虧損的，在應納稅所得額這一欄不能填負數，應該填0。